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SFB 716 C08
Molekulardynamik-Simulationen zur Bestimmung von Entfaltungspfaden und stabilen Konformationen von DNAG-Quadruplexen (C08*)
| Coordinator | Professor Dr. Johannes Kästner ; Dr. Jens Smiatek |
| Grant period | 2015 - 2018 |
| Funding body | Deutsche Forschungsgemeinschaft |
| DFG | |
| Identifier | G:(GEPRIS)265625039 |
⇧ SFB 716: Dynamische Simulation von Systemen mit großen Teilchenzahlen ⇧
Note: Mittels atomistischer Molekulardynamik-Simulationen sollen die Entfaltungspfade und stabilen Konformationen von DNA G-Quadruplexen untersucht werden. G-Quadruplexe bestehen aus nicht-Watson-Crick-artigen DNA-Strukturen, wobei sich wiederholende Sequenzen von Guanin typisch sind. Unter Berücksichtigung der Metadynamik-Methode sollen die Strukturen zur Entfaltung gebracht und die stabilen Konformationen anhand der berechneten freien Energielandschaften ermittelt werden. Weitere Analysen mittels der Umbrellaintegration sollen Aufschluss über die detaillierten Entfaltungspfade geben. Zusätzlich wird der Einfluss von Osmolyten auf die Stabilität der Strukturen untersucht.
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Record created 2021-09-20, last modified 2023-01-31