SFB 1309 A04

Molekulare Mechanismen der aktiven Demethylierung (A04)

CoordinatorProfessor Dr. Thomas Carell
Grant period2018 -
Funding bodyDeutsche Forschungsgemeinschaft
 DFG
IdentifierG:(GEPRIS)401882449

SFB 1309: Chemische Biologie epigenetischer Modifikationen

Note: Seit 2009 sind drei neue DNA-Basen (5-Hydroxymethyl-, 5-Formyl- und 5-Carboxy-Cytidin, hmdC, fdC und cadC) gefunden worden. Diese Basen kommen vor allem in der DNA vor, welche aus Stammzellen und Neuronen isoliert wurde. Wir glauben, dass fdC und cadC Deformylierungs- und Decarboxylierungsreaktionen eingehen, was einen neuen, lange gesuchten, Weg zur aktiven Demethylierung etablieren würde. Mit diesem Projekt planen wir direkten Einblick zu gewinnen, ob eine solche Decarboxylierungsreaktion in Stammzellen tatsächlich auftritt. Wir möchten die ersten Schritte unternehmen um die decarboxylierende Entität in Stammzellen aufzuklären, welche für die Reaktion verantwortlich ist. Im zweiten Teil des Projektes planen wir die Entwicklung neuer, robuster Sequenziermethoden, die es uns erlauben werden, die Positionen von hmdC und fdC im Genom zu bestimmen.
   

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 Record created 2023-01-19, last modified 2023-01-21