SFB 1371 P16
Charakterisierung karzinogener und entzündungsfördernder Sekundärmetabolite des humanen Darmmikrobioms (P16)
| Coordinator | Professor Dr. Tobias A. M. Gulder ; Professor Dr. Stephan A. Sieber ; Professor Dr. Georg Zeller |
| Grant period | 2019 - |
| Funding body | Deutsche Forschungsgemeinschaft |
| DFG | |
| Identifier | G:(GEPRIS)418600672 |
⇧ SFB 1371: Microbiome Signatures -- Funktionelle Relevanz des Mikrobioms im Verdauungstrakt ⇧
Note: In P16 werden biosynthetische Gencluster (BGCs) in Darmbakterien mittels in silico Analyse (meta)-genomischer Daten identifiziert. Zur Vorhersage einer Entzündungs- oder krebsfördernden Wirkung der kodierten Metabolite wird auf eine statistische Überrepräsentation in Metagenomen von Patienten mit Kolorektalkarzinom oder chronisch-entzündlichen Darmerkrankungen getestet. Vielversprechende BGC-Kandidaten werden kloniert sowie heterolog exprimiert, die so gezielt gewonnenen Metabolite isoliert sowie strukturell und funktionell charakterisiert. Ein besonderes Augenmerk liegt dabei aufgrund ihrer oftmals stark ausgeprägten zytotoxischen Aktivität auf Substanzen mit heterocyclischen Strukturelementen. Ein Schwerpunkt wird dabei auf der Aufklärung der zellulären Angriffsziele der Metabolite sowie deren Wirkungsweise mittels chemischer Proteomik liegen. Die Effekte der Metabolite auf den Wirt werden zusammen mit SFB 1371 - Partnern in Tiermodellen untersucht. P16 wird so neue Zusammenhänge zwischen mikrobiellem Metabolismus und Krankheitsentstehung aufdecken.