000286602 001__ 286602
000286602 005__ 20240928180446.0
000286602 0247_ $$aG:(GEPRIS)251151982$$d251151982
000286602 035__ $$aG:(GEPRIS)251151982
000286602 040__ $$aGEPRIS$$chttp://gepris.its.kfa-juelich.de
000286602 150__ $$aInferenz von Differenzierungsentscheidungen aus Stammzellgenealogien$$y2014 - 2018
000286602 371__ $$aDr. Carsten Marr
000286602 450__ $$aDFG project G:(GEPRIS)251151982$$wd$$y2014 - 2018
000286602 5101_ $$0I:(DE-588b)2007744-0$$aDeutsche Forschungsgemeinschaft$$bDFG
000286602 680__ $$aEine Differenzierungsentscheidung von Blutstammzellen lässt sich inEinzelzellexperimenten durch die Expression eines geeignetenfluoreszierenden Markerproteins feststellen. Zwischen der Entscheidungder Zelle und dem beobachtbaren Fluoreszenzsignal besteht jedoch einegewisse Verzögerung. In diesem Projekt wollen wir den tatsächlichenDifferenzierungszeitpunkt aus Stammbäumen von Blutstammzellenermitteln. Die Synchronizität des Einsetzens eines Markers zwischenSchwesterzellen, Cousinen, etc. erlaubt dabei die Zerlegung derDifferenzierungsdynamik in zwei Prozesse: Differenzierungsentscheidungund Markeraktivierung. Wir werden zunächst zelluläre Stammbäume miteinem generativen Modell erzeugen, wobei wir verschiedene molekulareMechanismen für die beiden Prozesse studieren. Daneben prozessierenund analysieren wir Stammzellbäume von Blutzellen aus dem Knochenmarkvon Mäusen (bereitgestellt vom Labor von Timm Schroeder, Stem CellDynamics research unit, Helmholtz Zentrum München). In diesenStammzellbäumen, die auf getrackten Einzelzell-Mikroskopiedatenbasieren, wird das Einsetzen des Markersignals annotiert oderquantitative bestimmt. Mit neuen und weiterentwickelten Methoden zurBauminferenz bestimmen wir den exakten Differenzierungszeitpunkt injedem Baum. Mit diesem Wissen können wir molekulare Mechanismen derMarkeraktivierung, den Einfluss von Linien-entscheidenden Faktoren,sowie mögliche räumliche Abhängigkeiten zwischen Zellen analysierenund besser verstehen. Die in diesem Projekt entwickelten Methodenlassen sich auf beliebige Stammbäume von differenzierenden undheterogenen Zellpopulationen, sowie verschiedene Nachweismethoden(morphologischen Veränderungen, oder Apoptose in spezifischenBedingungen) übertragen.
000286602 909CO $$ooai:juser.fz-juelich.de:953345$$pauthority$$pauthority:GRANT
000286602 909CO $$ooai:juser.fz-juelich.de:953345
000286602 980__ $$aG
000286602 980__ $$aAUTHORITY