Record #288721 - GSI Repository

DFG project G:(GEPRIS)262320096

Identifikation genetischer Risikofaktoren der Parodontitis durch kombiniertes QTL-Mapping in Mäusen und anschließender genomweiter Assoziationsanalyse und Hochdurchsatzgenotypisierung in Patienten der Aggressiven Parodontitis

Coordinator	Professor Dr. Arne Schäfer
Grant period	2014 - 2017
Funding body	Deutsche Forschungsgemeinschaft
	DFG
Identifier	G:(GEPRIS)262320096

Note: Parodontitis ist eine chronische Entzündungskrankheit der Mundhöhle, die zum Abbau parodontaler Gewebe und möglicherweise auch zu systemischen Erkrankungen führt. Ein hoher Anteil der Varianz der Bevölkerung kann genetischen Faktoren zugewiesen werden, bislang konnte aber nur ein Bruchteil der Heritabilität erklärt werden. Zur Identifikation eines umfassenderen Spektrums der genetischen Risikofaktoren schlagen wir eine Strategie zur unbefangenen de novo Erstellung von Hypothesen über Kandidatengene im menschlichen Genom vor, welche sowohl den Einschränkungen genomweiter Assoziationstudien als auch von Kandidatengen-Assoziationsstudien gleichermaßen Rechnung trägt. In einem systemgenetischen Ansatz sollen rekombinante Inzucht-Mauslinien (RILs) des Collaborative Cross zur Kartierung von Risikogenen der Parodontitis als quantitative Merkmale (quantitative trait loci [QTL]) verwendet werden. Die orthologen Abschnitte im menschlichen Genom, die den Maus-QTLs entsprechen, sollen als Kandidatengene für eine detaillierte Analyse in umfangreichen menschlichen Fall-Kontroll Populationen ausgewählt werden. Diese Regionen werden zunächst in silico auf eine mögliche Assoziation mit menschlicher Parodontitis validiert. Dazu sollen bereits bestehende genomweite Datensätze (Illumina HumanOmniExpress-24 v1.0) von 624 deutscher Patienten der Aggressiven Parodontitis (AgP) und >2.600 deutscher populationsrepresentativer Kontrollen verwendet werden. Die stärksten Assoziationen sollen in einer unabhängigen Fall-Kontroll-Population von 600 AgP Fällen Nordwest-europäischer und türkischer Herkunft, 2.200 deutsche chronische Parodontitis Patienten und 3.000 Kontrollen des gleichen ethnischen Hintergrundes repliziert und validiert werden. Im Anschluß sollen dann die kausativen Varienten durch gerichtete Re-Sequenzierungen identifiziert und validiert werden. Die Ergebnise werden dazu beitragen, die molekularen Mechanismen erhöhter Krankheitssukzeptibilität oder -resistenz gegen orale bakterielle Infektionen besser zu verstehen und zu erklären, warum sich die Immunantwort zwischen verschiedenen Individuen oftmals stark unterscheidet. Hierdurch hat das beantragte Projekt das Potential, frühzeitige Diagnosemöglichkeiten und Therapiemöglichkeiten oraler Entzündungskrankheiten zu verbessern.

Recent Publications

There are no publications

Record created 2023-01-31, last modified 2024-09-28

Similar records

Add to personal basket
Export as Author List with IDs BibTeX (UTF-8), EndNote XML, EndNote Text, RIS, MARC, Print MARC, MARCXML, DC,
Request correction
Submit fulltext

GSI Homepage \| GSI Library \| English Deutsch \| guest :: login GSI Repository
Search	Submit	Personalize Your alerts Your baskets Your searches	Help