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SFB 1588 A02
Untersuchung der Chromatin-Zugänglichkeit und der somatischen mitochondrialen DNAMutationslandschaften in einzelnen Zellen während der Entwicklung des Neuroblastoms (A02)
| Coordinator | Dr. Kerstin Haase ; Dr. Laleh Haghverdi ; Professor Dr. Jan Philipp Junker ; Dr. Leif Ludwig |
| Grant period | 2023 - |
| Funding body | Deutsche Forschungsgemeinschaft |
| DFG | |
| Identifier | G:(GEPRIS)525328338 |
⇧ SFB 1588: Entschlüsselung evolutionärer Mechanismen beim Neuroblastom ⇧
Note: Das Projekt testet die Integration von Einzelzell-Zustandsdaten mit klonaler Inferenz als Strategie zur Identifizierung von klonaler Tumorpopulationsdynamik und genomischer Heterogenität. Es werden Multi-omics-Daten von einzelnen Tumorzellen genutzt, um eine ergänzende Strategie zur Überwachung klonaler Erkrankungen in Flüssigbiopsien zu entwickeln. Chromatinlandschaften und CNVs und mtDNA-Mutationen werden genutzt, um genregulatorische Elemente und Transkriptionsfaktoraktivitäten in Tumor- und Immunzellen zu entschlüsseln und um (sub-)klonale Populationen von sich entwickelnden Tumoren und ihrer immunen Mikroumgebung zu rekonstruieren. Zellfreie mtDNA wird als Methode zur Krankheitsüberwachung evaluiert.
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Record created 2023-08-08, last modified 2025-05-28